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查询苹果手机删除的短信可以通过以下几种方法。
1、使用iCloud备份恢复：如果之前有在iCloud中备份过手机数据，可以尝试通过以下步骤恢复已删除的短信：打开iPhone的【设置】，点击【通用选项】，选择【还原】，再选择【从iCloud备份恢复】，选择最近的备份文件，等待恢复过程完成即可，需要注意的是，此方法会覆盖当前手机上的所有数据，因此操作前请确保备份是最新的并且包含所需的短信数据。
2、使用第三方软件恢复：如果没有使用iCloud备份或者恢复效果不佳，可以尝试使用第三方软件来恢复已删除的短信，可以使用一些数据恢复软件来扫描手机或iTunes备份文件，找到并恢复删除的短信，这种方法需要谨慎操作，以确保不会损坏手机数据或隐私。
3、查看iTunes备份文件：如果曾经通过iTunes备份过手机数据，可以尝试查看备份文件以找到已删除的短信，在电脑上打开iTunes，选择设备备份文件，然后提取出备份文件中的短信数据，可以使用一些第三方软件来帮助完成这个过程。
需要注意的是，无论使用哪种方法，都需要及时采取行动，因为时间越长，恢复的可能性就越小，为了保护个人隐私，操作前请确保了解相关风险并谨慎处理手机数据。
方法仅供参考，如有疑问，建议咨询苹果官方客服或相关技术人员以获取更专业的指导和帮助。